Les protéines • Fiche 6
Nous avons vu que les acides aminés se lient entre eux par des liaisons peptidiques pour former une chaîne polypeptidique. On distingue en réalité 3, voire 4, niveaux d'organisation des protéines :
La structure quaternaire ne concerne que les protéines constituées de plusieurs sous-unités (plusieurs chaînes polypeptidiques) : une protéine formée d'une seule chaîne s'arrête donc au niveau tertiaire.
LA STRUCTURE SECONDAIRE
La structure secondaire correspond au repliement local et répétitif du squelette peptidique, stabilisé par des liaisons hydrogène entre le groupement -C=O d'un acide aminé et le groupement -NH d'un autre acide aminé de la même chaîne. On distingue deux formes principales :
1. L'hélice α
La chaîne s'enroule sur elle-même en spirale régulière ; les liaisons hydrogène se forment entre acides aminés proches dans la séquence (en général séparés de 4 positions) et stabilisent chaque tour de l'hélice.
2. Le feuillet β (plisse)
Deux (ou plusieurs) segments de la chaîne, souvent éloignés dans la séquence, s'alignent côte à côte de manière quasi rectiligne ; les liaisons hydrogène se forment cette fois entre les brins, formant une structure en accordéon.
LA STRUCTURE TERTIAIRE
La structure tertiaire correspond au repliement global de la chaîne polypeptidique (hélices, feuillets et zones non structurées) en une forme tridimensionnelle compacte et fonctionnelle. Elle est stabilisée par les interactions entre les radicaux R des acides aminés, même lorsqu'ils sont éloignés dans la séquence :
Fais glisser chaque point coloré vers la liaison qui lui correspond :
- liaison ionique entre radicaux chargés
- liaison hydrogène entre radicaux polaires
- interactions hydrophobes entre radicaux apolaires, regroupés au cœur de la protéine à l'abri de l'eau
- pont disulfure entre deux cystéines
Une protéine n'est fonctionnelle qu'une fois repliée !
QCM
Q1 - La structure secondaire est stabilisée par des liaisons hydrogène au sein du squelette peptidique.
| Vrai |
| Faux |
Q2 - Dans un feuillet β, les liaisons hydrogène se forment entre deux brins de la chaîne plutôt qu'à l'intérieur d'un seul tour d'hélice.
| Vrai |
| Faux |
Q3 - La structure tertiaire ne fait intervenir que des liaisons hydrogène entre radicaux R.
| Vrai |
| Faux |
Q4 - Dans la structure tertiaire, les radicaux hydrophobes se retrouvent généralement au cœur de la protéine.
| Vrai |
| Faux |